Музей було відкрито у середній школі с. Сестринівка у 1996 році до 130-річчя з дня народження Михайла Грушевського. Сестринівка – родинна колиска його предків, її вчений вважав своєю духовною батьківщиною. До 140-річчя від дня народження Грушевського було побудовано нове приміщення для музею, оновлено і розширено експозицію. У 2006 році закладу присвоєно звання «народний», а нині він є відокремленим структурним підрозділом Вінницького обласного краєзнавчого музею.
Фонди закладу нараховують близько 400 предметів, щорічно музей приймає понад 4000 відвідувачів.
Матеріали музейної експозиції висвітлюють головні аспекти життєвого і творчого шляху Михайла Грушевського, його родинні корені. Історико-етнографічний комплекс характеризує с. Сестринівку другої половини ХІХ століття, коли туди приїздив Михайло Грушевський. В експозиції представлено родовід Оппокових, висвітлено роль діда Захарія Оппокова, священника Покровської церкви с. Сестринівка, в становленні світогляду молодого Михайла Грушевського. Свідки тогочасних подій – світлини і документи батьків, братів і сестер – розкривають величезну родинну шану, яку Михайло Сергійович сповідував до кінця своїх днів, опікуючись своїми рідними і близькими.
Надзвичайну цінність складають залікова книжка за 1893 рік студента богословського факультету Львівського університету Івана Березовського з власноручним підписом Михайла Сергійовича Грушевського, передана музею Олегом Івановичем Міклухою, головним лікарем Козятинської районної лікарні; витяг з метричної книги Покровської церкви с. Сестринівка за 1882 рік. Центральне місце в експозиції музею відведено матеріалам про період життя Грушевського як політика, що очолював з березня 1917 року по квітень 1918 року у період національного піднесення і відродження Української держави Українську Центральну Раду.
Наукова спадщина, архівні документи, листи, газетні публікації, вміщені в експозиції, засвідчують геніальну багатогранність Михайла Грушевського – людини енциклопедичних знань, організатора українського наукового життя, провідного історичного діяча у всеукраїнському і світовому вимірі.
У 2016 р. у с. Сестринівка відбувся V обласний фестиваль-конкурс музейних міні-експозицій «Віхи державотворення на Вінниччині», присвячений 150-річчю від дня народження М. С. Грушевського та вшануванню його пам’яті. У заході взяли участь 14 музеїв області.